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NIES collection MICROBIAL CULTURE COLLECTION General information Search on strains data List of strains Taxonomic index Alphabetical index How to order Cart Japanese HOME Search Strain Data Strain Data Strain Data Strain Data Reference --> Strain number NIES-945   Phylum Cyanophyta   Class Cyanophyceae   Scientific name Synechococcus sp.   Synonym   Former name   Common name Blue-green alga ; Cyanobacteria   Locality (Date of collection) Lake Biwa, North Basin, Shiga, Japan (1990-09-12)   Latitude / Longitude   Habitat (Isolation source) Freshwater (Lake water)   History Isolator (Date of isolation) Takamura, Noriko (1990-11-**)   Identified by Takamura, Noriko   State of strain Cryopreservation; Unialgal; Non-axenic[2017 Mar]   Culture condition (Preculture condition) Medium:  C   Temperature:  15 C Light intensity:  9-11 µmol photons/m2/sec, L/D cycle:  10L:14D Duration:  2 M   Gene information 16S rRNA ( AF216951 ) , cpcBA-IGS ( AF223428 ) , rpoC1 ( AF245124 ) , petB ( LC716313 )   Cell size (min - max) 1 - 2 μm   Organization Unicellular  Characteristics Picoplankton   Other strain no. Other strain no. : B 1   Remarks Cryopreserved  Movie   Reference Suzuki, S., Yamaguchi, H., Kawachi, M. 2022 Potential genetic diversity of Synechococcus-related strains maintained in the Microbial Culture Collection of the National Institute for Environmental Studies, Japan. Microb. Resour. Syst., 38, 63-74. Keywords: Synechococcus; Cyanobium; picoplankton; molecular marker Strain(s): 937,  938,  939,  940,  941,  942,  943,  945,  946,  947,  949,  950,  951,  952,  953,  954,  955,  956,  957,  958,  959,  960,  961,  962,  963,  964,  965,  969,  970,  971,  972,  973,  974,  975,  976,  977,  978,  979,  981,  982,  983,  984,  985,  986,  987,  988,  1341,  1342,  1343,  1344,  1345,  1346,  1347,  1348  Asukabe, H., Akahori, S., Ueno, E., Nakayama, T., Yamashita, R., Arii, S., Harada, K., Imanishi, S. Y. 2020 Cyanobacterial classification with the toxicity using MALDI Biotyper. J. Am. Soc. Mass Spectrom., 31, 1572-1578. Keywords: cyanobacteria; MALDI Biotyper; microcystins; profiling Strain(s): 27,  39,  42,  73,  81,  87,  89,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  107,  111,  112,  207,  208,  230,  266,  298,  416,  433,  478,  510,  512,  515,  592,  593,  604,  611,  808,  809,  835,  843,  846,  847,  905,  928,  931,  932,  945,  981,  989,  1025,  1043,  1058,  1061,  1064,  1068,  1069,  1071,  1076,  1085,  1099,  1101,  1105,  1113,  1115,  1126,  1133,  1134,  1135,  1144,  1157,  1215,  1642,  1643,  1652,  1668,  1672,  1673,  1677,  1678,  1698,  2087,  2131,  2412,  2665,  3708,  3733,  3734,  3736,  3755,  3756,  3757  PubMed: 32501712 DOI: 10.1021/jasms.0c00148 Robertson, B. R., Tezuka, N., Watanabe, M. M. 2001 Phylogenetic analyses of Synechococcus strains (cyanobacteria) using sequences of 16S rDNA and part of the phycocyanin operon reveal multiple evolutionary lines and reflect phycobilin content. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 51, 861-871. Keywords: cyanobacteria; phycocyanin; phylogeny; 16S rDNA; Synechococcus Strain(s): 937,  938,  939,  940,  941,  942,  943,  944,  945,  946,  947,  948,  949,  950,  951,  952,  953,  954,  955,  956,  957,  958,  959,  960,  961,  962,  963,  964,  965  PubMed: 11411708 DOI: 10.1099/00207713-51-3-861 Unauthorized copying and replication of text, images, and tables in our homepage, are prohibited. PAGE TOP 16-2 Onogawa, Tsukuba, Ibaraki 305-8506, JAPAN TEL +81-29-850-2556 FAX +81-29-850-2587 Send us an e-mail () FAQ Privacy policy ©National Institute for Environmental Studies. All Rights Reserved. Since 1 October 2001